The End of Evangelion dient als Alternative zum TV-Ende und ersetzt die Serienfolgen 25 und 26 mit einem zweigeteilten Kinofilm. Nach dem Tod von Kaworu in Episode 24 ist Shinji komplett lethargisch, während SEELE mit JSDF-Soldaten und der fertiggestellten Evangelion-Serie bei NERV einfällt und sogar versucht, den MAGI zu hacken. Kann der Third Impact abgewendet werden oder gelingt es den alten Herren, ihren Human Instrumentality Project zu vollenden? Und inwiefern unterscheidet sich das alternative Finale wirklich vom ursprünglichen Ende? Track 26 spult zurück und fängt noch mal beim Showdown an.