全球珊瑚礁正在承受嚴重的生存威脅，並且快速消失；成功的珊瑚礁保育有賴於有效的國際合作。「珊瑚礁大使」計畫跨國和跨領域地結合台灣屏東和美國加州聖地牙哥兩地，專業的珊瑚科學家和業餘的珊瑚礁愛好者、水族館工作人員、中學學生與教師、以及海域觀光遊憩活動業者，並以設立在兩地學校教室之中，模擬台美兩國珊瑚礁的生態缸，經由遠距學習、教育與研究，促進青年實作參與尖端科技，以及發展跨文化研究與保護此重要海洋生態系統未來的關鍵技能。

「珊瑚礁大使」計畫的合作夥伴單位，包括台灣的國立海洋生物博物館、恆春國中、騏艦潛水中心，以及美方的加州大學聖地牙哥分校博趣水族館、聖地牙哥高科技高中、和聖地牙哥台美基金會等。經由此國際合作計畫，將更進一步促進台美之間的教育、研究與文化交流，以及墾丁和全球珊瑚礁的保育和永續發展。